気象神社は、昭和19年（1944）4月、大日本帝国陸軍の陸軍気象部（杉並区）の構内に造営された。御祭神は、八意思兼命（やごころおもいかねのみこと）。軍にとって気象条件は戦略を講じるのに大事な要素であり、科学的根拠に基づいた予報がなされていたが、予報適中を祈願するなど、気象観測員の心のよりどころとされていた。
　戦後、神道指令で撤去されるはずだったが、調査漏れにより残存、先々代宮司の山本実が受入れを決断して、昭和23年（1948）9月に遷宮祭を斎行し、高円寺氷川神社に遷された。
　社殿老朽化も進んだため、遷宮五十五周年記念として、平成15年（2003）に再建され現在に至る。